Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn4O35054 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cldn4O35054 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn4O35054 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms