Protein–RNA interactions for Protein: O08791

Ebf3, Transcription factor COE3, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf3O08791 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ebf3O08791 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ebf3O08791 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ebf3O08791 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ebf3O08791 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms