Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcof1O08784 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tcof1O08784 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tcof1O08784 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tcof1O08784 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tcof1O08784 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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