Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nfil3O08750 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nfil3O08750 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nfil3O08750 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nfil3O08750 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms