Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3aO08665 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema3aO08665 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sema3aO08665 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3aO08665 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms