Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20878L7N244 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20878L7N244 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20878L7N244 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20878L7N244 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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