Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vmn2r88L7N1W8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r88L7N1W8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms