Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al1oL7MU04 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2al1oL7MU04 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms