Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ59

Gm3383, Predicted gene 3194, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3383J3QQ59 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3383J3QQ59 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3383J3QQ59 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3383J3QQ59 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3383J3QQ59 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms