Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5814J3QP80 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5814J3QP80 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5814J3QP80 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5814J3QP80 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms