Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY1

Gm9242, Predicted pseudogene 9242, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9242J3QNY1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9242J3QNY1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9242J3QNY1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9242J3QNY1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms