Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm21976J3QNN2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21976J3QNN2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21976J3QNN2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21976J3QNN2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21976J3QNN2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm21976J3QNN2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm21976J3QNN2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm21976J3QNN2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm21976J3QNN2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm21976J3QNN2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm21976J3QNN2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Gm21976J3QNN2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm21976J3QNN2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm21976J3QNN2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm21976J3QNN2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm21976J3QNN2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm21976J3QNN2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm21976J3QNN2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm21976J3QNN2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm21976J3QNN2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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