Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930544D05RikJ3QK56 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930544D05RikJ3QK56 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930544D05RikJ3QK56 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930544D05RikJ3QK56 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms