Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Gm21969J3QJZ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gm21969J3QJZ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25,08■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Gm21969J3QJZ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms