Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20830J3KML6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20830J3KML6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20830J3KML6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms