Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AK157302I3ITR1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AK157302I3ITR1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AK157302I3ITR1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AK157302I3ITR1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AK157302I3ITR1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms