Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm29394H3BIW7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm29394H3BIW7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm29394H3BIW7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm29394H3BIW7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 376.9 ms