Protein–RNA interactions for Protein: G3XA57

Rab11fip2, Rab11 family-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip2G3XA57 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip2G3XA57 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip2G3XA57 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip2G3XA57 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip2G3XA57 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip2G3XA57 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip2G3XA57 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab11fip2G3XA57 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab11fip2G3XA57 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab11fip2G3XA57 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms