Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933406M09RikG3XA12 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933406M09RikG3XA12 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933406M09RikG3XA12 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933406M09RikG3XA12 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933406M09RikG3XA12 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
4933406M09RikG3XA12 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4933406M09RikG3XA12 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms