Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnf148G3X9R7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf148G3X9R7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf148G3X9R7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnf148G3X9R7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnf148G3X9R7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf148G3X9R7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf148G3X9R7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf148G3X9R7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms