Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgxb3G3X9M3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hmgxb3G3X9M3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hmgxb3G3X9M3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hmgxb3G3X9M3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hmgxb3G3X9M3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms