Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nccrp1G3X9C2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nccrp1G3X9C2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nccrp1G3X9C2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nccrp1G3X9C2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms