Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Zkscan2G3X952 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zkscan2G3X952 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zkscan2G3X952 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zkscan2G3X952 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms