Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim15G3UY57 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim15G3UY57 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim15G3UY57 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim15G3UY57 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim15G3UY57 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim15G3UY57 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim15G3UY57 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim15G3UY57 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim15G3UY57 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim15G3UY57 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim15G3UY57 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim15G3UY57 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim15G3UY57 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim15G3UY57 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim15G3UY57 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim15G3UY57 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim15G3UY57 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim15G3UY57 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim15G3UY57 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim15G3UY57 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms