Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Speer4cG3UXD1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Speer4cG3UXD1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Speer4cG3UXD1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Speer4cG3UXD1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms