Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG4

H2-T24, Histocompatibility 2, T region locus 24, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T24F8VQG4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-T24F8VQG4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-T24F8VQG4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H2-T24F8VQG4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-T24F8VQG4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms