Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pira2F8VQ94 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pira2F8VQ94 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pira2F8VQ94 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pira2F8VQ94 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pira2F8VQ94 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pira2F8VQ94 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pira2F8VQ94 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pira2F8VQ94 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pira2F8VQ94 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pira2F8VQ94 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pira2F8VQ94 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pira2F8VQ94 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pira2F8VQ94 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms