Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r76F8VQ63 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r76F8VQ63 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r76F8VQ63 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r76F8VQ63 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r76F8VQ63 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r76F8VQ63 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r76F8VQ63 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms