Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,84
Arid4aF8VPQ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26,46■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Arid4aF8VPQ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Arid4aF8VPQ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Arid4aF8VPQ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,1 ms