Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5160F8VPN3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5160F8VPN3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm5160F8VPN3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5160F8VPN3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms