Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20538F6Z9R1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm20538F6Z9R1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20538F6Z9R1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms