Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610001J05RikF2Z3Y9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610001J05RikF2Z3Y9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
2610001J05RikF2Z3Y9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms