Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prss56F2YMG0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prss56F2YMG0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prss56F2YMG0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms