Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nolc1E9Q5C9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nolc1E9Q5C9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nolc1E9Q5C9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms