Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20518E9Q548 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20518E9Q548 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20518E9Q548 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms