Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip11E9Q512 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trip11E9Q512 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trip11E9Q512 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trip11E9Q512 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms