Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms