Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430550D23RikE9Q1X6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6430550D23RikE9Q1X6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms