Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gcom1E9PZ54 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcom1E9PZ54 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gcom1E9PZ54 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gcom1E9PZ54 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms