Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Parp4E9PYK3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp4E9PYK3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp4E9PYK3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms