Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rsf1E9PWW9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
Rsf1E9PWW9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Rsf1E9PWW9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rsf1E9PWW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rsf1E9PWW9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rsf1E9PWW9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms