Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc175E9PVB3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc175E9PVB3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc175E9PVB3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms