Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930558K02RikE0CXC6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
4930558K02RikE0CXC6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930558K02RikE0CXC6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms