Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
5430403G16RikD3Z5L4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
5430403G16RikD3Z5L4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms