Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm3676D3Z236 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm3676D3Z236 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3676D3Z236 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3676D3Z236 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.9 ms