Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl10D3YWW5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rtl10D3YWW5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl10D3YWW5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtl10D3YWW5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms