Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rexo5D3YW29 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rexo5D3YW29 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rexo5D3YW29 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rexo5D3YW29 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms