Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim30cD3YVI9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim30cD3YVI9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30cD3YVI9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30cD3YVI9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms