Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tmf1B9EKI3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Tmf1B9EKI3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Tmf1B9EKI3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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