Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf518bB2RRE4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf518bB2RRE4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf518bB2RRE4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms